Биоразнообразие

Результаты инвентаризации различных групп флоры и фауны; в скобках указаны авторы аннотированных списков и научные учреждения, с которыми у заповедника были заключены договора о научном сотрудничестве).

• Водоросли - 183 вида ( к.б.н. Алексеева Е.Н., Иркутский государственный университет).
• Грибы-макромицеты – 205 видов (к.б.н. Петров А.Н., Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, г. Иркутск)
• Лишайники – 378 видов (к.б.н. Лиштва А.В., под руководством к.б.н. Макрый Т.В., Центральный Сибирский ботанический сад СО РАН, г. Новосибирск)

Мохообразные

• Листостебельные мхи – 208 видов (д.б.н. Бардунов Л.В., Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН, г. Иркутск)
• Печеночные мхи – 51 вид (к.б.н Мамонтов Ю.М., Полярно-альпийский ботанический сада-институт им. Н.А. Аврорина КНЦ РАН (г. Кировск Мурманской области)
• Сосудистые растения - 715 видов (Чечеткин Е.В., Чечеткина Л.Г., под руководством д.б.н. профессора Малышева Л.И., Центральный Сибирский ботанический сад СО РАН, г. Новосибирск)

Животные

• Млекопитающие – 36 видов (Сигарев В.А., Белянин В.Н.)
• Рептилии – 1 вид (Сигарев В.А.)
• Земноводные – 4 вида (Сигарев В.А., Волков С.Л.)
• Птицы – 252 вида (Белянина И.С., Иванова С.В., Полушкин Д.М., Волков С.Л.)
• Рыбы – 23 вида (д.б.н. Матвеев А.Н., к.б.н. Самусенок В.П., к.б.н. Юрьев А.Л., Иркутский государственный университет)
• Насекомые –  350 видов (Шаврин А.А., Иркутский государственный университет, к.б.н. Горбунов П.Ю., Екатеринбургский государственный университет, д.б.н. профессор Ануфриев Г.А., Нижегородский государственный университет)